同型半光氨酸为一含硫氨基酸，正常机体内存在的少量同型半光氨酸进一步降解为半光氨酸，或整合叶酸/B12代谢过程转化为蛋氨酸。过量的同型半光氨酸损伤血管壁的机制至今并未完整的建立。Welch等认为同型半光氨酸与低密度脂蛋白反应后经吞噬细胞吞噬，细胞破裂沉积于血管壁，通过一系列反应并有副产物氧化物放出，损伤血管壁后，平滑肌细胞分裂修补造成“疤痕”。Dr MrDonnel指出同型半光氨酸改变凝血因子水平，造成血小板凝聚粥样硬化等。

    临床上，在跟踪5年15000个高同型半光氨酸的男性中发现，排除其它因素后，其心脏病的机会增加3倍。每增加5umol/L同型半光氨酸浓度，中年男性局部缺血性心脏病机会增加1/3。

   大部分科技文献报道，同型半光氨酸正常值范围在5-15umol/L之间。