我们提出了一个通过对基因网络的相邻关系比较来确定功能相关基因的新方法。这个方法不依赖于基因的序列或者是蛋白的同源结构，它能够适用于任何的生物体和大量的实验数据集。预测基因关系的方法依赖于潜在的网络，这种基因关系关心的是生物过程，而不是一个分子的功能。我们用这个方法分析了在酵母基因组中进行的染色质免疫共沉淀实验，大范围基因删除研究以及转录因子结合位点实验中得到的基因网络。我们找到了159个基因之间的816个功能联系，并显示与这些联系相对应的蛋白蛋白相互作用，在同一个蛋白网络中的共同出现，以及在科学文献中的共同出现。我们的结果提示了7个以前未确定功能的酵母基因的功能：KIN3和YMR269W可能与细胞生长或维持的生物过程有关，而IES6, YEL008W, YEL033W, YHL029C, YMR010W和YMR031W-A可能有代谢的功能。

摘自：中国生物信息网