2001年人类基因组序列草图的发表使得两种不同测序方法形成鲜明对比。“私人”Celera序列采用“全基因组随机”法,即把基因组切成小DNA片段,对其各自进行测序,然后根据基因重叠将它们重新排序;“公共”序列采用“克隆顺序”法来对一个染色体上已知位置的大块DNA进行测序。公共测序工作在今后项目中也将采用随机方法,所以了解随机方法的测序能力至关重要。研究人员对最近的序列(公共版本的“Build34”)做了比较,发现随机方法的主要局限性是片段复制不够清楚。在很多情况下,复制是不存在的,导致对基因组大小的估计过低。但这一比较的确为怎样改进算法和杂合策略、以恢复“困难”区域提供了线索。(Analysis,p. 927)与此同时,“国际人类基因组测序组织”已能够供应“Build34”了,这标志着另一个里程碑。对常染色质基因组(转录成RNA的部分),从实用目的来说,测序工作已经结束。(Articles, p. 931; News and Views) 摘自:natureasia !-- content_end> |