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新的成人腹泻轮状病毒J19株NSP4和NSP5基因克隆和序列分析
发布时间2006年9月12日11时16分
 

  

蒋盛军  纪绍忠  唐青  杨红彦  崔晓英  毕烨  阚飙  高守一 

摘 要:目的克隆新的成人腹泻轮状病毒J19NSP4NSP5基因,并分析其基因序列.方法利用一种改进的非依赖核酸序列的单引物扩增方法扩增J19NSP4NSP5基因,克隆到pMD18-T载体中并进行测序.在此基础上,J19NSP4NSP5的蛋白序列与其他轮状病毒蛋白序列进行比较分析和种系进化分析.结果J19NSP4NSP5基因为基因1011,全长为739 bp649 bp,它们分别编码213个和176个氨基酸.J19NSP4NSP5蛋白序列一致性较高的分别是B组成人腹泻轮状病毒Bang373(20.3%)B组猪轮状病毒db101(29.5%).J19株的NSP4NSP5的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置都靠近ABC组轮状病毒分支的根部,而且它比较偏向B组轮状病毒的分支.结论J19株的NSP4NSP5与其他轮状病毒的相应蛋白序列存在显著差异.J19NSP4NSP5的蛋白序列比较和遗传进化分析表明新的成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒可能有共同起源;但是新的成人腹泻轮状病毒与成人腹泻轮状病毒存在显著差异.

摘自《中华微生物和免疫学杂志》2006年第4

 
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